Protein–RNA interactions for Protein: O00193

SMAP, Small acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAPO00193 FO393422.1-201ENST00000603908 708 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC118658.2-201ENST00000618697 459 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SNORA17.5-201ENST00000630429 132 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC074101.1-201ENST00000637861 241 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SMG1P4-204ENST00000523028 4131 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 TJP1-202ENST00000356107 6747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 TRIQK-206ENST00000518748 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 LRIT3-201ENST00000327908 3781 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
SMAPO00193 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 FOXP2-207ENST00000393494 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 ADAM18-202ENST00000379866 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 FABP12-201ENST00000360464 551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL451050.1-201ENST00000450126 415 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL159163.1-201ENST00000507747 600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SP2-AS1-204ENST00000585280 405 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL691477.1-201ENST00000624398 162 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
SMAPO00193 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 TET2-202ENST00000305737 9233 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC245028.1-201ENST00000423259 256 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL049745.1-201ENST00000433953 286 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 MIR1273E-201ENST00000581165 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
SMAPO00193 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
SMAPO00193 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
SMAPO00193 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 ADGRL3-203ENST00000506700 4838 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNA5SP319-201ENST00000362768 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNA5SP435-201ENST00000364044 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 COX6CP13-201ENST00000428703 226 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RN7SL447P-201ENST00000494711 245 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 BNIP3P1-201ENST00000547295 580 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
SMAPO00193 SNORA11.6-201ENST00000619030 128 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.8 ms