Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
NipblQ6KCD5 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
NipblQ6KCD5 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
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