Protein–RNA interactions for Protein: Q61116

Znf235, Zinc finger protein 235, mousemouse

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Length 645 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf235Q61116 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Znf235Q61116 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Znf235Q61116 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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