Protein–RNA interactions for Protein: P97371

Psme1, Proteasome activator complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psme1P97371 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Psme1P97371 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Psme1P97371 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms