Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prf1P10820 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms