Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Hoxb3P09026 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Hoxb3P09026 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.8 ms