Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.4 ms