Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Kdm5cP41230 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms