Protein–RNA interactions for Protein: Q6KCD5

Nipbl, Nipped-B-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NipblQ6KCD5 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
NipblQ6KCD5 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
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