Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pfdn6Q03958 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pfdn6Q03958 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms