Protein–RNA interactions for Protein: P41230

Kdm5c, Lysine-specific demethylase 5C, mousemouse

Predictions only

Length 1,554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5cP41230 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5cP41230 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5cP41230 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Kdm5cP41230 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Kdm5cP41230 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Kdm5cP41230 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms