Protein–RNA interactions for Protein: P15409

Rho, Rhodopsin, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RhoP15409 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RhoP15409 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
RhoP15409 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RhoP15409 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RhoP15409 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms