Protein–RNA interactions for Protein: A2ACT7

Col9a3, Collagen, type IX, alpha 3, mousemouse

Predictions only

Length 680 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col9a3A2ACT7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Col9a3A2ACT7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col9a3A2ACT7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms