Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP1

Speer3, MCG129800, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer3W4VSP1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Speer3W4VSP1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Speer3W4VSP1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer3W4VSP1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Speer3W4VSP1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Speer3W4VSP1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms