Protein–RNA interactions for Protein: U3KQK5

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQK5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
U3KQK5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQK5 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQK5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
U3KQK5 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQK5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
U3KQK5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
U3KQK5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
U3KQK5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
U3KQK5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
U3KQK5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
U3KQK5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
U3KQK5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
U3KQK5 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
U3KQK5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQK5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQK5 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQK5 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
U3KQK5 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
U3KQK5 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
U3KQK5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQK5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQK5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQK5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
U3KQK5 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQK5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
U3KQK5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQK5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQK5 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQK5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQK5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
U3KQK5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
U3KQK5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQK5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQK5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQK5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
U3KQK5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
U3KQK5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
U3KQK5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
U3KQK5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
U3KQK5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms