Protein–RNA interactions for Protein: U3KQ87

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KQ87 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQ87 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQ87 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
U3KQ87 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQ87 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQ87 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQ87 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
U3KQ87 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQ87 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQ87 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQ87 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
U3KQ87 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQ87 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQ87 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
U3KQ87 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
U3KQ87 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQ87 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
U3KQ87 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
U3KQ87 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
U3KQ87 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQ87 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQ87 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQ87 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQ87 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
U3KQ87 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
U3KQ87 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
U3KQ87 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQ87 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQ87 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQ87 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
U3KQ87 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQ87 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQ87 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQ87 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQ87 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
U3KQ87 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQ87 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
U3KQ87 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQ87 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQ87 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
U3KQ87 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQ87 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQ87 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
U3KQ87 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQ87 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQ87 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
U3KQ87 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQ87 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQ87 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQ87 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQ87 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
U3KQ87 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQ87 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQ87 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQ87 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
U3KQ87 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
U3KQ87 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
U3KQ87 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQ87 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
U3KQ87 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
U3KQ87 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQ87 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQ87 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
U3KQ87 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.4 ms