Protein–RNA interactions for Protein: S4R1W5

Rbm6, RNA-binding motif protein 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm6S4R1W5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbm6S4R1W5 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbm6S4R1W5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Rbm6S4R1W5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Rbm6S4R1W5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Rbm6S4R1W5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Rbm6S4R1W5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Rbm6S4R1W5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rbm6S4R1W5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Rbm6S4R1W5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Rbm6S4R1W5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Rbm6S4R1W5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms