Protein–RNA interactions for Protein: R4GNA1

MINOS1-NBL1, MICOS complex subunit MIC10 (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINOS1-NBL1R4GNA1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
MINOS1-NBL1R4GNA1 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MINOS1-NBL1R4GNA1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
MINOS1-NBL1R4GNA1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
MINOS1-NBL1R4GNA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms