Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Top3bQ9Z321 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Top3bQ9Z321 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Top3bQ9Z321 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Top3bQ9Z321 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Top3bQ9Z321 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Top3bQ9Z321 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.8 ms