Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2T6

Krt85, Keratin, type II cuticular Hb5, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt85Q9Z2T6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Krt85Q9Z2T6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Krt85Q9Z2T6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Krt85Q9Z2T6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Krt85Q9Z2T6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Krt85Q9Z2T6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Krt85Q9Z2T6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms