Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Vamp5Q9Z2P8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Vamp5Q9Z2P8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Vamp5Q9Z2P8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vamp5Q9Z2P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vamp5Q9Z2P8 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.6 ms