Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H5

Epb41l1, Band 4.1-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 879 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb41l1Q9Z2H5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Epb41l1Q9Z2H5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Epb41l1Q9Z2H5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Epb41l1Q9Z2H5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Epb41l1Q9Z2H5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Epb41l1Q9Z2H5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Epb41l1Q9Z2H5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Epb41l1Q9Z2H5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms