Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z273

Tulp1, Tubby-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp1Q9Z273 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Tulp1Q9Z273 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Tulp1Q9Z273 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tulp1Q9Z273 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tulp1Q9Z273 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tulp1Q9Z273 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tulp1Q9Z273 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.8 ms