Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0Y9

Nr1h3, Oxysterols receptor LXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Nr1h3Q9Z0Y9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Nr1h3Q9Z0Y9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nr1h3Q9Z0Y9 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nr1h3Q9Z0Y9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nr1h3Q9Z0Y9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms