Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0L3

Oc90, Otoconin-90, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oc90Q9Z0L3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Oc90Q9Z0L3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Oc90Q9Z0L3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Oc90Q9Z0L3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Oc90Q9Z0L3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Oc90Q9Z0L3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 191.3 ms