Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0E6

Gbp2, Guanylate-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp2Q9Z0E6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Gbp2Q9Z0E6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Gbp2Q9Z0E6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gbp2Q9Z0E6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gbp2Q9Z0E6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Gbp2Q9Z0E6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gbp2Q9Z0E6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms