Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6X0

SETBP1, SET-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETBP1Q9Y6X0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.66■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
SETBP1Q9Y6X0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
SETBP1Q9Y6X0 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.53■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
SETBP1Q9Y6X0 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC36.5■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
SETBP1Q9Y6X0 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.41■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.42
SETBP1Q9Y6X0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.36■■■■□ 3.41
SETBP1Q9Y6X0 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms