Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6S9

RPS6KL1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1Q9Y6S9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1Q9Y6S9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1Q9Y6S9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RPS6KL1Q9Y6S9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KL1Q9Y6S9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RPS6KL1Q9Y6S9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
RPS6KL1Q9Y6S9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPS6KL1Q9Y6S9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPS6KL1Q9Y6S9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPS6KL1Q9Y6S9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms