Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6F7

CDY2A, Testis-specific chromodomain protein Y 2, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDY2AQ9Y6F7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDY2AQ9Y6F7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDY2AQ9Y6F7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDY2AQ9Y6F7 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDY2AQ9Y6F7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDY2AQ9Y6F7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms