Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPC6Q9Y625 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC6Q9Y625 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GPC6Q9Y625 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GPC6Q9Y625 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms