Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN10AQ9Y5Y9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SCN10AQ9Y5Y9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SCN10AQ9Y5Y9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SCN10AQ9Y5Y9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SCN10AQ9Y5Y9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SCN10AQ9Y5Y9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms