Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X4

NR2E3, Photoreceptor-specific nuclear receptor, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR2E3Q9Y5X4 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
NR2E3Q9Y5X4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NR2E3Q9Y5X4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NR2E3Q9Y5X4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
NR2E3Q9Y5X4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NR2E3Q9Y5X4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.9 ms