Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5U5

TNFRSF18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF18Q9Y5U5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF18Q9Y5U5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF18Q9Y5U5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNFRSF18Q9Y5U5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
TNFRSF18Q9Y5U5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms