Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5P4

COL4A3BP, Collagen type IV alpha-3-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
COL4A3BPQ9Y5P4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
COL4A3BPQ9Y5P4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
COL4A3BPQ9Y5P4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
COL4A3BPQ9Y5P4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
COL4A3BPQ9Y5P4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms