Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5J5

PHLDA3, Pleckstrin homology-like domain family A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
PHLDA3Q9Y5J5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PHLDA3Q9Y5J5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PHLDA3Q9Y5J5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PHLDA3Q9Y5J5 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms