Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5F0

PCDHB13, Protocadherin beta-13, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB13Q9Y5F0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PCDHB13Q9Y5F0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PCDHB13Q9Y5F0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PCDHB13Q9Y5F0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PCDHB13Q9Y5F0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms