Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5E6

PCDHB3, Protocadherin beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB3Q9Y5E6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PCDHB3Q9Y5E6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCDHB3Q9Y5E6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PCDHB3Q9Y5E6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PCDHB3Q9Y5E6 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms