Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y546

LRRC42, Leucine-rich repeat-containing protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC42Q9Y546 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LRRC42Q9Y546 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LRRC42Q9Y546 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LRRC42Q9Y546 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LRRC42Q9Y546 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms