Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4G8

RAPGEF2, Rap guanine nucleotide exchange factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.07■■■■■ 4.33
RAPGEF2Q9Y4G8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC42.07■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.02■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.01■■■■■ 4.32
RAPGEF2Q9Y4G8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC41.99■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC41.99■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.98■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC41.96■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC41.94■■■■■ 4.31
RAPGEF2Q9Y4G8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC41.93■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC41.92■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
RAPGEF2Q9Y4G8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC41.88■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.86■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
RAPGEF2Q9Y4G8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC41.81■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC41.81■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC41.77■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC41.76■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
RAPGEF2Q9Y4G8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
RAPGEF2Q9Y4G8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.69■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC41.66■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC41.65■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC41.65■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC41.65■■■■■ 4.26
RAPGEF2Q9Y4G8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC41.64■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms