Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
HCN4Q9Y3Q4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HCN4Q9Y3Q4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
HCN4Q9Y3Q4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
HCN4Q9Y3Q4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HCN4Q9Y3Q4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
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