Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
AP3M1Q9Y2T2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
AP3M1Q9Y2T2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
AP3M1Q9Y2T2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3M1Q9Y2T2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms