Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Q0

ATP8A1, Phospholipid-transporting ATPase IA, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A1Q9Y2Q0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATP8A1Q9Y2Q0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ATP8A1Q9Y2Q0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ATP8A1Q9Y2Q0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ATP8A1Q9Y2Q0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms