Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2D8

SSX2IP, Afadin- and alpha-actinin-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX2IPQ9Y2D8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSX2IPQ9Y2D8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSX2IPQ9Y2D8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SSX2IPQ9Y2D8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
SSX2IPQ9Y2D8 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.3 ms