Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NOD1Q9Y239 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NOD1Q9Y239 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
NOD1Q9Y239 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NOD1Q9Y239 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms