Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Atp1a4Q9WV27 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Atp1a4Q9WV27 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Atp1a4Q9WV27 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Atp1a4Q9WV27 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Atp1a4Q9WV27 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Atp1a4Q9WV27 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.8 ms