Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sh3bgrQ9WUZ7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sh3bgrQ9WUZ7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sh3bgrQ9WUZ7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sh3bgrQ9WUZ7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sh3bgrQ9WUZ7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sh3bgrQ9WUZ7 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms