Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU78

Pdcd6ip, Programmed cell death 6-interacting protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd6ipQ9WU78 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd6ipQ9WU78 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd6ipQ9WU78 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Pdcd6ipQ9WU78 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Pdcd6ipQ9WU78 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Pdcd6ipQ9WU78 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Pdcd6ipQ9WU78 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Pdcd6ipQ9WU78 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Pdcd6ipQ9WU78 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Pdcd6ipQ9WU78 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Pdcd6ipQ9WU78 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.4 ms