Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Lemd3Q9WU40 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.29■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC35.27■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC35.26■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
Lemd3Q9WU40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC35.23■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.2■■■■□ 3.23
Lemd3Q9WU40 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.19■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC35.18■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC35.17■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
Lemd3Q9WU40 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Lemd3Q9WU40 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC35.07■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
Lemd3Q9WU40 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC35■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC35■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC34.99■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Lemd3Q9WU40 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC34.9■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Lemd3Q9WU40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Lemd3Q9WU40 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Lemd3Q9WU40 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lemd3Q9WU40 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Lemd3Q9WU40 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Lemd3Q9WU40 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms