Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PrkraQ9WTX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PrkraQ9WTX2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PrkraQ9WTX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PrkraQ9WTX2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PrkraQ9WTX2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms