Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ3

HPS5, Hermansky-Pudlak syndrome 5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS5Q9UPZ3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
HPS5Q9UPZ3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.47■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
HPS5Q9UPZ3 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC30.4■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
HPS5Q9UPZ3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
HPS5Q9UPZ3 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.3■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.29■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.28■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
HPS5Q9UPZ3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC30.23■■■□□ 2.43
HPS5Q9UPZ3 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms